Sobre a conta de -email que será usada na rotina, caso você já tenha uma conta de e-mail que o setor fiscal/contábil utiliza para armazenar os XMLs de NFe/CTe, sugiro criar uma nova conta, e na conta em uso tenha um encaminhamento automático para esta nova conta de e-mail que será usado na Central XML.
Recomendo isso, pois a Central XML sempre irá zerar a caixa de entrada quando executado o processo de leitura de e-mails.